1、在新版GSP第十一條和第十二條中明確規(guī)定：“（質(zhì)量負責人資質(zhì)）企業(yè)質(zhì)量負責人應(yīng)具有大學以上學歷，是執(zhí)業(yè)藥師”，“（質(zhì)量機構(gòu)負責人資質(zhì)）應(yīng)具有藥學及相關(guān)專業(yè)（指醫(yī)學、生物、化學等專業(yè)，下同）大專以上學歷，是執(zhí)業(yè)藥師”，這里明確規(guī)定了企業(yè)質(zhì)量負責人和企業(yè)質(zhì)量機構(gòu)負責人必須是執(zhí)業(yè)藥師，而在老版GSP中只是規(guī)定“企業(yè)負責人中應(yīng)有具有藥學專業(yè)技術(shù)職稱的人員，負責質(zhì)量管理工作; 企業(yè)質(zhì)量管理機構(gòu)的負責人，應(yīng)是執(zhí)業(yè)藥師或具有相應(yīng)的藥學專業(yè)技術(shù)職稱”
2、 多年來藥品經(jīng)營企業(yè)在經(jīng)營活動中一直沿用手工帳，紙質(zhì)文件傳遞的傳統(tǒng)管理方式，近年來隨著信息技術(shù)的發(fā)展，許多企業(yè)已經(jīng)開始嘗試使用計算機管理，新版GSP在第三十二條中明確規(guī)定“企業(yè)計算機管理信息系統(tǒng)的硬件設(shè)施和網(wǎng)絡(luò)環(huán)境應(yīng)符合以下要求：（一）有支持系統(tǒng)正常運行的服務(wù)器和終端機；（二）有穩(wěn)定、安全的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境，有固定接入互聯(lián)網(wǎng)的方式和可靠的信息安全平臺；（三）有符合企業(yè)經(jīng)營管理實際需要的應(yīng)用軟件和相關(guān)數(shù)據(jù)庫。”而在舊版之中則沒有要求。另外，新版GSP對倉庫的設(shè)施設(shè)備要求更高，在第二十八條中規(guī)定：“（倉庫設(shè)施設(shè)備）儲存藥品的倉庫應(yīng)有以下設(shè)施設(shè)備：……（二）有效調(diào)控溫濕度及進行室內(nèi)外空氣交換的設(shè)備；（三）自動監(jiān)測、記錄和調(diào)控庫房溫濕度的設(shè)備。而在舊版的GSP中只要求倉庫應(yīng)有檢測和調(diào)節(jié)溫、濕度的設(shè)備，沒有強調(diào)“自動監(jiān)測、記錄和調(diào)控”因此，新的GSP實施后企業(yè)將要增加新的設(shè)施設(shè)備，從硬件上提高標準，避免手工操作可能帶來的失誤。
3、 新版GSP在企業(yè)內(nèi)部各方面管理都有提高，從管理手段上增加了計算機管理信息系統(tǒng)，實現(xiàn)采購、驗收、入庫、養(yǎng)護、銷售、出庫等全程信息化，保證了準確無誤，客觀真實，這在第二十四條、第二十五條、第四十三條、第五十條中都有詳細闡述；同時在管理標準上細化了：藥品直調(diào)驗收、藥品運輸、中藥飲片標準、內(nèi)部評審、管理制度內(nèi)容等項目，彌補了舊版的不足，增加管理的嚴密性，例如，在新版GSP第五十二條中規(guī)定：“（藥品直調(diào)驗收）藥品直調(diào)時，如委托收貨單位驗收，應(yīng)與收貨單位簽訂委托驗收協(xié)議，由收貨單位嚴格按照本規(guī)范的要求進行驗收，建立專門的直調(diào)購進藥品驗收記錄，并將記錄及時反饋本企業(yè)。”
4、一直以來，各級食品藥品監(jiān)督管理局對藥品經(jīng)營企業(yè)的監(jiān)管以現(xiàn)場檢查為主，藥品的流向檢查以走訪為主，而新版GSP實施后監(jiān)管過程將會實現(xiàn)隨時化、自動化、直觀化、透明化，因為在新版GSP第二十三條中規(guī)定：“（計算機管理信息系統(tǒng)）企業(yè)應(yīng)建立計算機管理信息系統(tǒng)，能控制藥品購進、儲存、銷售等經(jīng)營環(huán)節(jié)質(zhì)量管理的全過程，具有實現(xiàn)接受藥品監(jiān)督管理部門電子監(jiān)管的條件。”這一監(jiān)管過程的實施將有效地提高食品藥品監(jiān)督管理局對經(jīng)營企業(yè)的監(jiān)管力度
5、 新版GSP不僅僅只是提高標準，同樣對舊版中存在的缺點也進行了修正，例如，在舊版GSP第二十三條和第二十四條中規(guī)定“有與經(jīng)營規(guī)模、范圍相適應(yīng)的藥品檢驗部門，配置相應(yīng)的檢驗儀器和設(shè)備。”“有與企業(yè)規(guī)模相適應(yīng)、符合衛(wèi)生要求的驗收養(yǎng)護室，配備必要的驗收和養(yǎng)護用工具及儀器設(shè)備。”根據(jù)這兩條企業(yè)都配備多種檢驗設(shè)備，無形中增加企業(yè)人力、物力和財力，但收效甚微，在新版GSP中則取消這一規(guī)定，既減輕了企業(yè)的負擔，又增強了藥品經(jīng)營企業(yè)在藥品質(zhì)量管理過程中的可操作性
6、制度要增加召回制度